醫學專碩與學碩的區別如下：
一、最重要最大的區別——規培。醫學專碩在讀期間直接下臨床進行三年住院醫師規范化培訓，即規培與碩士研究生教育同時進行。醫學學碩，如果畢業后要從事臨床工作，一般來說需要另外進行三年住院醫師規范化培訓，除非不在公立醫院工作，而且，所在醫院不要求規培才可以免去規培，這樣的工作，比如醫館、醫堂等等之類。
二、證書。專碩順利畢業后拿到的證書有：畢業證、規培證、碩士學位證、執業醫師證四張，也就是通常所說的四證合一。學碩順利畢業后可以拿到除去規培證外的三張證書，也就是意味著學碩將來要從事臨床，需要先進行三年規培，有三年的時間只能拿規培工資。
三、初試。專碩研究生初試為全國統一命題，內容在以往醫學綜合六科的基礎上增加醫學職業道德、倫理、衛生法學以及臨床技能的內容，具體增加的內容還需要等九月份大綱出來才能確定。而學碩內容大體沒變，醫學綜合依然是考傳統的六個科目，變化的是，從17屆考研開始由院校自主命題，也就是說，目標院校出題(比如，一同學是A院校的，打算考B院校的學碩，那初試的題目就是都是由B院校出的)，也就意味著，學碩對于本校考生會比較有利!
四、復試。專碩復試的時候更加重視專業和臨床技能的考核，會專門設置一個臨床技能考核。學碩則更傾向于專業和科研思維的考核，基本無臨床技能考核。當然，也不是所有院校都是這樣，比如南京中醫藥大學，專碩學碩都是要進行臨床技能考核，學碩要求一般會比較低些。具體還得看各院校實際安排。
五、專業代碼。學碩的專業代碼是100開頭，專碩的專業代碼是105開頭。舉個例子：中醫內科學專業學位的代碼是：105701;中醫內科學學術型學位：100506。
六、導師。專碩：由于開學后即下臨床進行住院醫師規范化培訓，進行臨床全科室輪科，因此與導師見面的時間很少，交流也會少很多，目前了解到的是第三年才在本科室輪轉，也就是說第三年的時候才會跟導師的接觸多一些。學碩：學碩將會從一開始就可以跟導師做實驗，做課題，與老師接觸多，一般是課題做完就可以開始跟老師門診學習了。
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